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关于举办超高分辨质谱Orbitrap Fusion Lumos在定量蛋白质组学方向应用的培训通知(76期)

为加强我校师生对大型科研仪器设备操作能力,掌握样品制备及仪器使用技能,充分发挥大型仪器设备作用,提高使用效率,按照学校统一安排,生命科学大型仪器共享平台于2023年11月12日举办超高分辨质谱Orbitrap Fusion Lumos在蛋白质组学方向应用培训,现将有关事项通知如下:

一、培训内容

重点介绍超高分辨质谱Orbitrap Fusion Lumos的基本操作,在定量蛋白质组学方面的应用。包括蛋白组学实验流程、定量蛋白质组学的原理、应用以及数据分析等。

二、培训时间

2023年11月12日  

上午9:00-11:00 理论培训      下午3:00-5:00 操作培训       

主讲人:任美娟      辅助:刘耀

三、培训地点

北校生命科学大型仪器共享平台多媒体室(老昆虫博物馆一层)

四、具体要求

1、请各相关单位组织学生微信扫码报名,限额60人,报满为止。

联系电话: 87092717

联系人:任老师、刘老师

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扫码报名  

培训结束后,全程参加培训的人员,由生命平台统一发放培训证书。

1、参加培训人员应提前10分钟到场,必须遵守学校和生命平台的各项规章制度,接受生命平台工作人员的管理,参加下午上机操作,需穿戴实验服,并做好进入生命平台登记记录。

仪器简介

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三合一超高分辨组合式质谱仪为Thermo Fisher生产,主要包括四级杆质量过滤器,双压线性离子阱和Orbitrap静电场轨道肼质量分析器,最高可达500000 FWHM的超高分辨能力(m/z 200),扫描速度可达20Hz,配有四种碎裂模式CID、HCD 、 ETD 和 EthcD。主要用于蛋白质组学或目标蛋白质研究,包括:高通量蛋白质鉴定,蛋白质相互作用鉴定,高通量蛋白质翻译后修饰分析,目标蛋白质监测、验证,使用标记或非标记方法进行蛋白质组高通量相对定量(差异比较),或目标蛋白质绝对定量,发现重要生理过程及疾病相关的生物标志物,寻找药物作用靶点等。

Spectronaut软件:

主要功能:Spectronaut是一款进行 DIA(Data-independent acquisition,数据非依赖采集)数据分析的软件,为DIA数据的分析提供完整的解决方案,包括谱图库构建、数据质控、蛋白定量、统计分析、GO富集等

特性:

1.支持多个CPU核心同时计算

2.支持全自动高通量DDA,DIA数据搜索并构建谱图参考数据库

3.支持Thermo、Sciex、Agilent、Bruker、Waters等质谱公司数据

4.支持DIA, SWATH,SONAR等数据格式直接定性定量分析、匹配谱图库定量分析

5.满足基于Java的完全可视化界面,流程化分析,所有分析模块、结果查询界面均集成在统一界面中

6.满足支持输出蛋白、肽段可视化报告,支持通用格式sne输出,支持对接Skyline等软件的专有格式输出